Oefenen in het water heeft een aantal voordelen; De belasting op het lichaam wordt fors verminderd. Schokbelastingen worden vermeden. Dankzij het warme water neemt de doorbloeding toe. Afvalstoffen en oedeem (vocht) worden versneld afgevoerd dankzij die doorbloeding toename en dankzij de druk die het water uitoefent. Hydrotherapie werkt daarmee pijn verlagend. Patiënten die op het droge angstig zijn om te bewegen of te vallen kunnen in het water vrijuit bewegen.
Trauma patiënten (bijvoorbeeld na een heup breuk) die een been niet of maar gedeeltelijk mogen belasten kunnen in het water heel zorgvuldig de belasting weer opbouwen. Ook geblesseerde topsporters kunnen zo trainen op maat.
Aangetoond is dat bij het trainen in het water de doorbloeding van de hersenen toeneemt. Aquarevalidatie wordt dan ook veel gebruikt voor C.V.A. patiënten. Het oefenen kost de neurologische patiënten in het water minder kracht. Er kan dan ook langer geoefend worden.